Adapun batas wilayah kerja Puskesmas Kejajar 2 dibatasi oleh :
Batas utara : Kecamatan Bawang, Kabupaten Batang
Batas timur : Desa Tieng, Kecamatan Kejajar, Kabupaten Wonosobo
Batas selatan : Kecamatan Watumalang, Kabupaten Wonosobo
Batas barat : Kecamatan Batur, Kabupaten Banjarnegara